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生物信息学,相互作用网络分析和神经网络表征根性囊肿和根尖周肉芽肿的基因表达

发布时间:2020-12-25 16:36:01 文章编辑:郑州天伦不孕不育医院 阅读:1845

摘要

介绍:生物信息学已成为分析不同疾病研究产生的大量数据的重要工具。在该研究中,基于前导基因方法表征了根性囊肿(RC)和根尖周肉芽肿(PG)的基因表达。

方法:应用经过验证的生物信息学算法来识别RC和PG的前导基因。与RCs和PGs相关的基因首先在PubMed,GenBank,GeneAtlas和GeneCards数据库中鉴定。使用可通过网络获得的STRING软件(欧洲分子生物学实验室[EMBL],海德堡,德国巴登-符腾堡,德国),以通过名为加权链接数的显着性得分在鉴定出的基因之间构建相互作用图。基于链接的加权数量辅助生殖哪里成功率高,使用k均值对基因进行聚类。最高簇中的基因被认为是前导基因。多层感知器神经网络分析被用作基因分类的补充。

结果:促排期可以吃黄瓜吗对于RCs,建议的前导基因是TP53和EP300,而PG与IL2RG,CCL2,CCL4,CCL5,CCR1,CCR3和CCR5基因相关。

结论:我们的数据揭示了RCs和PG的不同基因表达,表明不仅炎症性质而且其他生物学过程也可能区分RCs和PG。

郑州天伦不孕不育医院_1

关键词:牙髓病学;TH1;TH2;基因;高通量生物学。

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