背景:从Granny Smith苹果品种(GenBank登录号DQ185063)分离编码家蝇多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白1(MdPGIP1)的家蝇多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白1(MdPGIP1)基因。该基因用于转化烟草和马铃薯,以增强对真菌病的抗性。
调查结果:对MdPGIP1核苷酸序列的分析显示该基因包含993个核苷酸,其编码330个氨基酸的多肽。MdPGIP1多肽的计算机角色塑造显示了PGIP蛋白的典型结构域,包括一个24个氨基酸的信号肽、一个潜在的信号肽切割位点[丙氨酸备孕准备-亮氨酸-丝氨酸(ALS)]、一个238个氨基酸的富亮氨酸重复序列(LRR)结构域、一个46个氨基酸的N端结构域和一个22个氨基酸的C端结构域域。MdPGIP1的亲水性评估表明LRR域中存在重复的疏水基序,并且亲水表面积与球状蛋白一致。在MdPGIP1中鉴定出Asn-X-Ser/Thr的典型共有糖基化序列,表明MdPGIP1潜在的N-连接糖基化。非糖基化MdPGIP1的分子量计算为36.615kDa,理论等电点为6.98。此外,对MdPGIP1的二级和三级结构进行建模,并揭示MdPGIP1是弯曲且细长的分子,其LRR结构域上含有片B1,片B2和310螺旋。
结论:MdPGIP1蛋白的总体性质类似于原型菜豆PGIP2(PvPGIP2),并且检测到的差异支持其在生物技术应用中用作靶向真菌多聚半乳糖醛酸酶(PG)的抑制剂。
12-02
06:04
12-02
06:04
12-02
06:04